Rencontres R 2023, Avignon
Université de Lyon, Université Lyon 1, CNRS, VetAgro Sup
Université de Lyon, Université Lyon 1, CNRS, VetAgro Sup
CNRS-NMU-UCBL, Nelson Mandela University
Sustainability Research Unit
21 juin 2023
Appareils photos à déclenchement automatique
Savoir quelles espèces sont présentes, quand et où
Souvent deux tableaux :
Observations
Pièges photos
| Espèce | Date | Heure | Piège photo | … |
|---|---|---|---|---|
| elephant | 2023-21-06 | 14:57:12 | CAM1 | |
| elephant | 2023-24-06 | 06:06:42 | CAM2 | |
| gnou | 2023-24-06 | 07:42:11 | CAM1 |
| Piège photo | Latitude | Longitude | … |
|---|---|---|---|
| CAM1 | 43.9790 | 4.8909 | |
| CAM2 | 43.9500 | 4.8159 | |
| CAM3 | 43.9521 | 4.8074 |
Photo icons created by Pixel perfect - Flaticon | Table icons created by Pixel perfect - Flaticon
Indicateurs descriptifs : nombre de pièges photos actifs, durée d’échantillonnage…
Graphiques : cartes, barplots d’abondances…
Analyses spécifiques aux pièges photos: activité temporelle et occupation de l’espace des espèces
Permet d’utiliser tous les outils du package (vignettes, documentation, facilité d’installation et gestion des dépendances)
Le package Shinymeta permet de générer le code R pour reproduire l’analyse Shiny en mode non-interactif
capture d’écran -> visualiser des morceaux de code ou télécharger le Rmd avec l’analyse complète
Permettre à tout le monde de visualiser les données de pièges photos sans code : chercheur·euses, gestionnaires…
En s’appuyant sur l’écosystème R en écologie / analyse de données de pièges photos
https://github.com/LisaNicvert/camtrapviz
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